Se encuentra localizado en una tribuna anexa al coro alto de la iglesia, en posición exenta y en el lado del Evangelio, integrado en el espacio de la clausura del monasterio.
El aspecto actual del instrumenso se corresponde al resultado de la profunda restauración de la que se ha beneficiado el instrumento, la cual finalizó en el año 2019 y llevada a cabo por el taller de Federico Acitores, y gracias a la aportación económica que resultó del convenio suscrito entre el Patronato de la Alhambra y el Generalife, Cervezas Alhambra y el Ayuntamiento de Granada. Esta intervención le ha devuelto al instrumento su total operatividad.
El instrumento es obra de Antonio de Quesada, quien lo construyera entre 1779 y 1780, aprovechando registros de un órgano anterior. Su caja es de línea barroca, de la 2ª mitad del s. XVIII, habiendo permanecido siempre en madera vista. Sobre su cornisa superior destaca un medallón franciscano.
Son conocidas sucesivas intervenciones como la de Fernando Antonio de Madrid en 1792; la de Miguel González Aurioles en 1806 y de cierta envergadura; la de Adolfo Montero Weiss, quien posiblemente restaurara su fuelle; y entre 1930 y 1930 la de Pedro Ghys Guillemín, quién realizó reformas y la aportación de la sonoridad romántica al instrumento.
Sobre su fachada principal se observan cinco castillos de tubería, siendo el I, III y V en torreón, siendo el III el que contiene los tubos de mayor calibre. Los castillos II y IV están partidos en dos campos. De éstos, los campos superiores alberga tubos no cantantes.
También dispone de una trompetería horizontal, en disposición de Ave María a dos filas, estando la superior partida en dos tramos.
Las transmisiones de teclado y registros son mecánicas.
Diversas puertas permiten el acceso al interior del mueble.
La fachada derecha está tapada con tablas, la cual pudo acoger en algún momento cañería de contras. De forma asimétrica, la izquierda está cerrada con otro tipo de tablas y una tabla decorada. La contrafachada carece de decoración alguna.
La consola es en ventana y de un solo teclado, disponiendose a ambos lados una región de tiradores de registros.
El fuelle se localiza a la izquierda del mueble, estando operativo como tal, aunque es posible la alimentación de viento a través de una motobomba.
Desde este momento, es uno de los instrumentos con los que se cuenta para la celebración de conciertos de música en la capital granadina.